More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4102 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  100 
 
 		 226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  70.59 
 
 		 230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  71.16 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  71.88 
 
 		 230 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  66.99 
 
 		 230 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  64.9 
 
 		 252 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  63.46 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  54.11 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  55.77 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  51.17 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  57.41 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  57 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  59.09 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  54.36 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  57.07 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  53.33 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  53.89 
 
 		 211 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  57.3 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  51.4 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  54.11 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  55.45 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  55.84 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  57.65 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  51.6 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 214 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  46.73 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  51.87 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  45.28 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.02 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.86 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.27 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.47 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.53 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.21 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.66 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.66 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  48.66 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  42.45 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 210 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 688 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.54 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.51 
 
 		 688 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  48.84 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.65 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  44.74 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.13 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  49.03 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.21 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.19 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.69 
 
 		 703 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  46.81 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 686 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 705 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 200 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  45.21 
 
 		 207 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  42.33 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  42.33 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.44 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.68 
 
 		 686 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 671 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.06 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.54 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  42.36 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  43.94 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  43.22 
 
 		 707 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.92 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  45.21 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.22 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  40.28 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>