More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1292 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  71.89 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  71.56 
 
 		 226 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  65.58 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  62.1 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  58.77 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  55.92 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  55.71 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  53.17 
 
 		 230 aa  224  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  54.84 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  52.88 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  55.5 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  55.61 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  52.97 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  56.76 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  48.43 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  55.96 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 208 aa  197  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 252 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  55.1 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  51.76 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  48.2 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  50.26 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  49.48 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 215 aa  178  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  45.45 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.61 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 686 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.41 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 205 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 208 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 688 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 686 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.54 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.12 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 707 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.31 
 
 		 688 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  49.2 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  46.5 
 
 		 207 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.58 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.06 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  42.58 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 705 aa  158  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  40.44 
 
 		 233 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 671 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  49.51 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.81 
 
 		 703 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.78 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 901 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 210 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  44 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.19 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 208 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  39.02 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  43.75 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  41.4 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  43.27 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  42.79 
 
 		 217 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.65 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  38.5 
 
 		 210 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36.95 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>