More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0484 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  58.71 
 
 		 209 aa  221  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  58.74 
 
 		 207 aa  214  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  51.53 
 
 		 209 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  51.78 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  50 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  53.09 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.92 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  48.69 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  53.66 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  51.69 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  46.03 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.44 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.19 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.81 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.36 
 
 		 244 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  48.72 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  49 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  47.32 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  48.99 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 210 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.29 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  44.93 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.44 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.74 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.72 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  46.63 
 
 		 662 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.68 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  46.86 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.29 
 
 		 686 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 686 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.18 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  39.32 
 
 		 688 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  42.05 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  44.33 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.93 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 688 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  44.93 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.41 
 
 		 901 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  38.28 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  45.77 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 671 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 707 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>