More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0460 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.7 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  47.37 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  43.09 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  45.95 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.65 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.88 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.16 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.62 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.86 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  39.15 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  44.15 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.68 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  44.15 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  38.6 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.31 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  40.96 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.32 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  45.26 
 
 		 226 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 236 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  45.7 
 
 		 225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.63 
 
 		 686 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.22 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.02 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.78 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  45.03 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  45.26 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  45.03 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  43.39 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  43.39 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.39 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  38.16 
 
 		 226 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.09 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.27 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.24 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.74 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.15 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.57 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.09 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.62 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  41 
 
 		 209 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  41.27 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.41 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  39.89 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.63 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  42.05 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.49 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.68 
 
 		 671 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.31 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.53 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  40.86 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  42.64 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  38.1 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.74 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  39.2 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.49 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 686 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.77 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  41.58 
 
 		 688 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  38.19 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  40.11 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 707 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  40.69 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  38.79 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>