More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0085 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  63.46 
 
 
215 aa  280  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  65.67 
 
 
212 aa  279  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  62.93 
 
 
215 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  62.56 
 
 
224 aa  274  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  53.16 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  49.21 
 
 
213 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.6 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  47.76 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48 
 
 
213 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.15 
 
 
210 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.77 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  51.85 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  51.32 
 
 
225 aa  177  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.06 
 
 
206 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.35 
 
 
217 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.28 
 
 
219 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.43 
 
 
210 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  52.79 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.28 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.28 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.27 
 
 
225 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.78 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.47 
 
 
222 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  44.33 
 
 
223 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.63 
 
 
233 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  39.81 
 
 
207 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.68 
 
 
207 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  42.33 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.56 
 
 
686 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  42.31 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.71 
 
 
204 aa  162  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  39.61 
 
 
210 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.19 
 
 
202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.62 
 
 
707 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40.65 
 
 
215 aa  161  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44.06 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.18 
 
 
225 aa  160  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  45.13 
 
 
240 aa  160  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  41.29 
 
 
209 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.16 
 
 
217 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.16 
 
 
217 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  44.1 
 
 
226 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.9 
 
 
686 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.97 
 
 
688 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.79 
 
 
208 aa  158  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.68 
 
 
225 aa  158  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.16 
 
 
207 aa  158  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.71 
 
 
222 aa  158  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.26 
 
 
688 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  41.58 
 
 
236 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  43.68 
 
 
232 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  41.35 
 
 
705 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43 
 
 
205 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  40.87 
 
 
703 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.71 
 
 
671 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.27 
 
 
212 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.53 
 
 
217 aa  156  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  43.59 
 
 
225 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  37.62 
 
 
208 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.52 
 
 
214 aa  155  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  42.23 
 
 
214 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.38 
 
 
213 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.79 
 
 
901 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  42.93 
 
 
662 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  38.76 
 
 
234 aa  154  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  41.09 
 
 
226 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  39.59 
 
 
214 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  42.13 
 
 
219 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  38.76 
 
 
203 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  37.5 
 
 
216 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.58 
 
 
229 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  40.19 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  44.5 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  42.93 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.1 
 
 
208 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  40.65 
 
 
207 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  40.67 
 
 
210 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  39.25 
 
 
218 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  42.44 
 
 
211 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  42.86 
 
 
218 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  42.08 
 
 
244 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.37 
 
 
234 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40 
 
 
206 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  39.42 
 
 
216 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.1 
 
 
213 aa  150  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  35.58 
 
 
211 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.87 
 
 
226 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  42.49 
 
 
210 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.72 
 
 
210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  40.59 
 
 
221 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  42 
 
 
244 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  40.59 
 
 
217 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  41.51 
 
 
209 aa  148  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  38.5 
 
 
211 aa  148  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  41.43 
 
 
210 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  38.92 
 
 
199 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  40.19 
 
 
211 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  39.9 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>