More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0026 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  75.71 
 
 
214 aa  340  9e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  59.5 
 
 
208 aa  264  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  54.59 
 
 
208 aa  258  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  54.59 
 
 
208 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  55.07 
 
 
208 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  55.07 
 
 
208 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  55.07 
 
 
208 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  55.07 
 
 
208 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  55.07 
 
 
208 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  55.07 
 
 
208 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  54.59 
 
 
208 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  54.11 
 
 
208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  57.97 
 
 
211 aa  250  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  55.29 
 
 
213 aa  244  8e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  58.67 
 
 
213 aa  232  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  53 
 
 
211 aa  227  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  51.44 
 
 
217 aa  218  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  53.5 
 
 
203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  50.98 
 
 
205 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  50.98 
 
 
205 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  53.27 
 
 
209 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  49.28 
 
 
213 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  47.42 
 
 
206 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  48.28 
 
 
203 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.93 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.03 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.61 
 
 
207 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.93 
 
 
219 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  44.71 
 
 
209 aa  179  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  43.14 
 
 
213 aa  179  2e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  47.69 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.69 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.13 
 
 
225 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.62 
 
 
205 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.41 
 
 
207 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  43.43 
 
 
211 aa  174  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.14 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.3 
 
 
671 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  42.79 
 
 
208 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  46.83 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  41.26 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.23 
 
 
212 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.84 
 
 
219 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  45.79 
 
 
233 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  45.64 
 
 
206 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.3 
 
 
686 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.18 
 
 
707 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  41.35 
 
 
226 aa  168  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.12 
 
 
213 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.87 
 
 
213 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  40.51 
 
 
217 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.67 
 
 
211 aa  166  2e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.52 
 
 
686 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.55 
 
 
212 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.12 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.08 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  45.63 
 
 
226 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.15 
 
 
217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.69 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  43.08 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.1 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.69 
 
 
215 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.08 
 
 
205 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.3 
 
 
705 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.5 
 
 
221 aa  161  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  37.5 
 
 
234 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.78 
 
 
703 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  42.93 
 
 
207 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  40 
 
 
216 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.05 
 
 
212 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  40.72 
 
 
222 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.25 
 
 
224 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  42.05 
 
 
210 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  40.78 
 
 
210 aa  158  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.19 
 
 
901 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.65 
 
 
210 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  39.7 
 
 
207 aa  157  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.11 
 
 
688 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.04 
 
 
229 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  37.68 
 
 
234 aa  155  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  40 
 
 
210 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.42 
 
 
206 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  39.62 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  44.1 
 
 
210 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39.42 
 
 
219 aa  155  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  41.33 
 
 
225 aa  154  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  39.69 
 
 
688 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  40.91 
 
 
202 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  41.24 
 
 
218 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  42.35 
 
 
218 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.76 
 
 
226 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  43.81 
 
 
210 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  42.42 
 
 
206 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  38.62 
 
 
211 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  38.76 
 
 
236 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.27 
 
 
214 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.15 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.41 
 
 
208 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  40.67 
 
 
214 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>