More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0040 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  50.53 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.5 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  51.08 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  54.3 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  48.48 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.69 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  45.02 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.99 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.47 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.36 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 686 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.12 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.08 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  47.73 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40.85 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  40.98 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  47.29 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  47.26 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  47.4 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  43.68 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 686 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.65 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  42.33 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  42.65 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  41.54 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 688 aa  154  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 901 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  41.46 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.07 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.47 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  43.23 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  41.21 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  47.51 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  42.38 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.51 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 243 aa  148  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.93 
 
 		 688 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  37.91 
 
 		 295 aa  148  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  39.44 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.09 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  41.62 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 671 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.5 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.88 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  41.45 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.28 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  38.21 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 244 aa  144  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  41.62 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>