More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2940 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  69.37 
 
 
226 aa  304  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  68.61 
 
 
229 aa  293  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  57.45 
 
 
236 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  52.36 
 
 
210 aa  201  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.69 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.91 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.88 
 
 
216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.24 
 
 
219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  46.15 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  45.28 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.95 
 
 
205 aa  178  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.07 
 
 
213 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.13 
 
 
210 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.4 
 
 
208 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  42.06 
 
 
205 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  42.06 
 
 
205 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.75 
 
 
207 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.75 
 
 
207 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  45.29 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  45.28 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.42 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.58 
 
 
207 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.4 
 
 
207 aa  171  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.06 
 
 
213 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  44.02 
 
 
214 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.54 
 
 
212 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  45.1 
 
 
217 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  43.19 
 
 
214 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  41.04 
 
 
203 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.81 
 
 
212 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.34 
 
 
208 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.63 
 
 
211 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.66 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39.55 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.06 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  43.93 
 
 
210 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.46 
 
 
705 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  42.47 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40.65 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  43.65 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  38.79 
 
 
203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  41.18 
 
 
234 aa  161  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.35 
 
 
217 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  39.91 
 
 
233 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.18 
 
 
211 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.4 
 
 
703 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  45.05 
 
 
220 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.87 
 
 
213 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  41.35 
 
 
219 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.55 
 
 
234 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  46.73 
 
 
217 aa  158  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  42.86 
 
 
237 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  39.9 
 
 
211 aa  157  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  44.91 
 
 
209 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  41.44 
 
 
213 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.48 
 
 
671 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  43.28 
 
 
225 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  48.22 
 
 
202 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43.69 
 
 
213 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.06 
 
 
232 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41.71 
 
 
210 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.84 
 
 
686 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41.9 
 
 
207 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  42.25 
 
 
214 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  39.52 
 
 
208 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.39 
 
 
686 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  42.25 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  47.09 
 
 
215 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  36.57 
 
 
209 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  40.74 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.95 
 
 
216 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.47 
 
 
210 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  44.39 
 
 
225 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  42.92 
 
 
210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  41.51 
 
 
211 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  151  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  40.65 
 
 
225 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  43.15 
 
 
219 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.72 
 
 
215 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  47.09 
 
 
225 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.71 
 
 
223 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  41.83 
 
 
197 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.09 
 
 
206 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  39.05 
 
 
208 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  41.83 
 
 
197 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  41.67 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  39.15 
 
 
208 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  38.43 
 
 
208 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  43.13 
 
 
230 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  39.35 
 
 
223 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  37.04 
 
 
206 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  41.2 
 
 
211 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>