More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0683 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  49.32 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  50.46 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  46.15 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.58 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.05 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  43.75 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.5 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.38 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  46.35 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  39.9 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 202 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  42.58 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  42.25 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.59 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.71 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  44.12 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  40 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  43.48 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.63 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.44 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.6 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.82 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  41.4 
 
 		 705 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.39 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.06 
 
 		 707 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 686 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.72 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.19 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.04 
 
 		 901 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 688 aa  147  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.38 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  39.53 
 
 		 703 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.28 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  37.98 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  37.09 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  38.1 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42 
 
 		 671 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  45.03 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  41.31 
 
 		 662 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  43.68 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  40.85 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  39.05 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  36.67 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  38.58 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  39.61 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  38.16 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  43.85 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  37.98 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  40.62 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  37.5 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  43.16 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  40.5 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>