More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0498 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  60.85 
 
 
226 aa  279  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  60.43 
 
 
229 aa  278  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  57.45 
 
 
225 aa  259  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.48 
 
 
217 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.39 
 
 
207 aa  184  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.65 
 
 
212 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.23 
 
 
217 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.4 
 
 
213 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40.89 
 
 
219 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.33 
 
 
216 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.15 
 
 
213 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  41.05 
 
 
216 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.73 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.98 
 
 
225 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  38.43 
 
 
203 aa  161  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.48 
 
 
215 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.64 
 
 
205 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.65 
 
 
207 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  39.65 
 
 
208 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.91 
 
 
671 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.83 
 
 
214 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.81 
 
 
225 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  38.4 
 
 
205 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  38.4 
 
 
205 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  42.59 
 
 
221 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.06 
 
 
210 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  41.47 
 
 
207 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.44 
 
 
206 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  40.27 
 
 
207 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.47 
 
 
208 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.61 
 
 
202 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  38.6 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.16 
 
 
211 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  40.64 
 
 
223 aa  154  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  38.77 
 
 
222 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34.51 
 
 
203 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.48 
 
 
214 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.76 
 
 
210 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40.09 
 
 
208 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  38.77 
 
 
208 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.17 
 
 
216 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41.28 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  39.21 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.89 
 
 
211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  40.48 
 
 
210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.3 
 
 
688 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  38.94 
 
 
218 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  39.47 
 
 
207 aa  151  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  38.46 
 
 
214 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  35.9 
 
 
219 aa  151  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  40.83 
 
 
210 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  40.87 
 
 
210 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41.23 
 
 
207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  40.97 
 
 
230 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  40.35 
 
 
213 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  40.09 
 
 
224 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  40.76 
 
 
210 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  45.15 
 
 
230 aa  148  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  36.7 
 
 
212 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  36.8 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  35.96 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  40.87 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  41.9 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  40.28 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  38.96 
 
 
686 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  37.39 
 
 
295 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.55 
 
 
686 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  35.71 
 
 
226 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  39.61 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  38.96 
 
 
217 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  36.56 
 
 
221 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.62 
 
 
211 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  35.09 
 
 
223 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  37.39 
 
 
218 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  39.55 
 
 
232 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  38.36 
 
 
215 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  38.57 
 
 
217 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  38.46 
 
 
234 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  42.16 
 
 
233 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.76 
 
 
213 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  41.83 
 
 
225 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  39.47 
 
 
212 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  34.65 
 
 
223 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  40.89 
 
 
220 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  37.61 
 
 
211 aa  141  7e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  36.4 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  38.01 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  38.43 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  35.32 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  37.8 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.52 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>