More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0609 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  434  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  59.07 
 
 		 671 aa  238  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  60.19 
 
 		 688 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  60.29 
 
 		 686 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  58.37 
 
 		 705 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  58.25 
 
 		 703 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 707 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  56.78 
 
 		 686 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  55.22 
 
 		 901 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  56.37 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  59.22 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  59.79 
 
 		 688 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  54.84 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  48.77 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.74 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  55.88 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  56.92 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 707 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  53.62 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  50.71 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  56.37 
 
 		 662 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.92 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  46.86 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  51.22 
 
 		 281 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  49.06 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  47.42 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  48.82 
 
 		 730 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  50 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.37 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  50 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  48.83 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 213 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.84 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  46.97 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.1 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.27 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.88 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  51.79 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49.75 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  49.75 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  50.26 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  48.31 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  46.67 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.79 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.98 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.17 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  45.26 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  46.05 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.52 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.84 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.9 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  46.73 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  50.47 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  48.98 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.23 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  47.8 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  45.32 
 
 		 209 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  38.24 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.32 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.91 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 209 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>