More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3110 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  56.46 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  52.66 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  52.66 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  55.77 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  54.55 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  53.4 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  55.83 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  58.25 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  50 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  53.85 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  54.33 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  54.11 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  55.22 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  56.86 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  50.78 
 
 		 211 aa  194  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  48.76 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  55.33 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  56.77 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  48.82 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  54.81 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  49 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 234 aa  177  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  51.53 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.31 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  53.92 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  51.67 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.27 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  49 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.86 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.71 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  48.95 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 225 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.51 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.86 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.52 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46.38 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  42.18 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.18 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  46.08 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.93 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.91 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.06 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.11 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.45 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  43.93 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  38.66 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  39.7 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  38.92 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 688 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  39.62 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  39.2 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 705 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>