More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1257 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  100 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  59.8 
 
 		 209 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  58.74 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  48.66 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  51.6 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 688 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.15 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  50.54 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  48.78 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  48.08 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  44.97 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  50.26 
 
 		 244 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  50.27 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  47.31 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  48.99 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  48.96 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  47.96 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.39 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  44.61 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  47.03 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 901 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  48.42 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.12 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.64 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  46.03 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 686 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  50 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  40.49 
 
 		 688 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.92 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 686 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  39.25 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  45.6 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.76 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  45.5 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  45 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  49.51 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.7 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.1 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 223 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.16 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  37.75 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  33.99 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 671 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.36 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  49.74 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  42.19 
 
 		 707 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  40.2 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  43 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 705 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.95 
 
 		 703 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  34.65 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  47.06 
 
 		 662 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  44 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  37.68 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 217 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  42.55 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  48 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  37.68 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>