More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4325 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  100 
 
 		 217 aa  420  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  57.77 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  58.91 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  58.13 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  56.22 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  62.37 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  58.65 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  58 
 
 		 211 aa  221  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  56.19 
 
 		 208 aa  221  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  57.43 
 
 		 214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  60.71 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  57 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  60.77 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  56.31 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  59.68 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  57.43 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  56.73 
 
 		 230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  56.88 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  59.5 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  62.14 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  53.85 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  57.69 
 
 		 252 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  57.97 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  49.01 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  58.17 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  50.48 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.24 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.03 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  49 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  49.06 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  54.3 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.27 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  46.41 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  53.23 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  53.62 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.5 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  51.78 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.05 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.98 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.46 
 
 		 688 aa  167  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  52.88 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.54 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  44.91 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  49.21 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.54 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 705 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.5 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.67 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 707 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.06 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  44 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  42.72 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  46.73 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.02 
 
 		 703 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.55 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.62 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.23 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 686 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.44 
 
 		 688 aa  157  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  42.33 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  44.59 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.61 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 686 aa  154  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.19 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  47.14 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40.29 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  46.38 
 
 		 662 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>