More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1464 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  85.65 
 
 		 230 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  69.78 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  68.18 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  71.88 
 
 		 226 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  66.82 
 
 		 230 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  63.6 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  58.79 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  55.45 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  57.14 
 
 		 244 aa  224  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  53.69 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  54.19 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  54 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  56.22 
 
 		 237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  60.11 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  58.21 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  53.4 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  59.8 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  54.73 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  55.83 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  53.5 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  52.88 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  59.18 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  55.41 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  55.67 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.08 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.92 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  44.22 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.19 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.98 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.77 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.23 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  48.95 
 
 		 199 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.96 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.97 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  46.83 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  48.02 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.45 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.15 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.97 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  45.32 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  47.34 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.81 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  42.36 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  48.6 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  39.58 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  50.5 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.9 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.16 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  40.76 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  43.27 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.92 
 
 		 688 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.83 
 
 		 705 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  42.31 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45 
 
 		 703 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  44.98 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  42.86 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  40.19 
 
 		 688 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.68 
 
 		 901 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.37 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>