More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0400 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  48.33 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 217 aa  195  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.48 
 
 		 212 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.23 
 
 		 671 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.67 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 686 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.18 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 213 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  46 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.72 
 
 		 688 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  48.42 
 
 		 225 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.65 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.51 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.83 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.3 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 686 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.29 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.15 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  50.25 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 688 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  42.01 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  47.76 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.75 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.26 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  42.55 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  45.64 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.09 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  48.24 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  47.57 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.65 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  35.71 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  40.29 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  41.88 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  39.81 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 211 aa  160  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  40.95 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.62 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.8 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  40.44 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.84 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  39.32 
 
 		 244 aa  158  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 901 aa  158  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 230 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.97 
 
 		 703 aa  158  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  42.02 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  38.89 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 209 aa  157  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  41.45 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  39.89 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  40 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  43.68 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 705 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  38.68 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  40.61 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.82 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  41.58 
 
 		 244 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  37.31 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  42 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.81 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 707 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  42 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  38.57 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  41.08 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  41.4 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.81 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  41.51 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  38.58 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  44.51 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  41.63 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  37.98 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  37.32 
 
 		 225 aa  148  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 217 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>