More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2155 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  68.69 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  68.22 
 
 		 226 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  65.58 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  60.95 
 
 		 214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  61.43 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  60.58 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  60.78 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  55.92 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  53.14 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  50.23 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  56.04 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  57 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  57.58 
 
 		 244 aa  203  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  57.43 
 
 		 217 aa  197  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  57.07 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  54.03 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49.28 
 
 		 209 aa  195  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  55.79 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  47.69 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  53.62 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  47.69 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 688 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.44 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.95 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.12 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  45.54 
 
 		 688 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.23 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.46 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 686 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.28 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 686 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  47.62 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  50.97 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36.89 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.26 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 901 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  44.29 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.91 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  45.21 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.99 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.93 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 705 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  42.25 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.92 
 
 		 703 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  32.24 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 210 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  44.7 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 671 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  39.38 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.08 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  42.36 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.15 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.63 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  37.26 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>