More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3153 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  100 
 
 		 213 aa  430  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  66.19 
 
 		 217 aa  298  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  65.71 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  62.5 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  61.84 
 
 		 219 aa  266  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  65.24 
 
 		 225 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  64.29 
 
 		 225 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  57.07 
 
 		 216 aa  226  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  53.17 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  48.33 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  48.37 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.63 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  51.22 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.19 
 
 		 215 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.34 
 
 		 210 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  45.75 
 
 		 211 aa  187  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.76 
 
 		 210 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.76 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.83 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.76 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.58 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 901 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 209 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.07 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.03 
 
 		 688 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  47.64 
 
 		 688 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.23 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 686 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  44.29 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  45.75 
 
 		 244 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  52.15 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 671 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 686 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.92 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  43.27 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  48.98 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  45.54 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.97 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.69 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  41.94 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 707 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.31 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 225 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.15 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  42.45 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  42.66 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  44.66 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.93 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.96 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 705 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.13 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>