More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3467 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  73.15 
 
 		 688 aa  992    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  53.92 
 
 		 686 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  100 
 
 		 686 aa  1351    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  52.66 
 
 		 688 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  48.18 
 
 		 901 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 707 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  47.47 
 
 		 730 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  49.32 
 
 		 662 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  45.68 
 
 		 709 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  50.36 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.48 
 
 		 705 aa  515  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  50.29 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.23 
 
 		 703 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 710 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 		 727 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  38.78 
 
 		 642 aa  354  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 725 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  61.26 
 
 		 213 aa  221  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  60.29 
 
 		 225 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  55.5 
 
 		 232 aa  204  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  54.11 
 
 		 226 aa  204  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  53.73 
 
 		 222 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 243 aa  196  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  49.31 
 
 		 224 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 205 aa  191  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  48.6 
 
 		 215 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  49.02 
 
 		 207 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  53.93 
 
 		 221 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 208 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 206 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  47.52 
 
 		 207 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 207 aa  183  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  53.73 
 
 		 219 aa  183  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.79 
 
 		 207 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  47.06 
 
 		 234 aa  182  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 206 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.21 
 
 		 204 aa  181  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  48.74 
 
 		 211 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.67 
 
 		 219 aa  180  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 213 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  48.06 
 
 		 216 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 215 aa  177  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 217 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.6 
 
 		 213 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  48.76 
 
 		 224 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  49.54 
 
 		 281 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 207 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 212 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 202 aa  173  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  47.64 
 
 		 215 aa  173  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 209 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 210 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 217 aa  172  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 209 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  48.29 
 
 		 221 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  45.85 
 
 		 222 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.33 
 
 		 203 aa  169  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 214 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 210 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 213 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 213 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 236 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 225 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  46.56 
 
 		 211 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.69 
 
 		 214 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 218 aa  164  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 215 aa  164  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49.21 
 
 		 244 aa  164  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 234 aa  164  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 213 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  48.22 
 
 		 236 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.92 
 
 		 212 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 226 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  39.9 
 
 		 206 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  49.21 
 
 		 244 aa  161  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  40 
 
 		 211 aa  161  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 221 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.89 
 
 		 233 aa  160  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 225 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 205 aa  158  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  42.72 
 
 		 210 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 225 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  43.14 
 
 		 207 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 295 aa  155  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 210 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.47 
 
 		 234 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 225 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  43.72 
 
 		 199 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 225 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  45.79 
 
 		 226 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.15 
 
 		 225 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  47.67 
 
 		 244 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.9 
 
 		 210 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 210 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42.49 
 
 		 197 aa  154  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 207 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 213 aa  154  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.99 
 
 		 210 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 214 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>