More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8399 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  100 
 
 		 901 aa  1784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  51.7 
 
 		 688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.43 
 
 		 688 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  49.13 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  44.43 
 
 		 730 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.18 
 
 		 686 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  42.58 
 
 		 709 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  46.56 
 
 		 662 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.96 
 
 		 707 aa  502  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 705 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.9 
 
 		 703 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  44.53 
 
 		 707 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 727 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 710 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  39.68 
 
 		 671 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 725 aa  317  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  33.87 
 
 		 642 aa  293  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  54.46 
 
 		 213 aa  218  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  56.72 
 
 		 224 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 210 aa  214  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  52.89 
 
 		 222 aa  211  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  50.42 
 
 		 281 aa  211  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  53.08 
 
 		 215 aa  210  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  50.46 
 
 		 226 aa  201  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  54.73 
 
 		 225 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 205 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  53.33 
 
 		 206 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  47.93 
 
 		 221 aa  199  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  48.15 
 
 		 219 aa  197  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  52.66 
 
 		 234 aa  195  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  51.47 
 
 		 232 aa  194  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  47.64 
 
 		 203 aa  190  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  48 
 
 		 207 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  51.24 
 
 		 243 aa  187  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 206 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 202 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  48.06 
 
 		 214 aa  183  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.55 
 
 		 213 aa  181  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  46.34 
 
 		 207 aa  179  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 226 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.05 
 
 		 236 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.31 
 
 		 216 aa  172  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 210 aa  171  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 225 aa  171  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 219 aa  171  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.78 
 
 		 212 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.37 
 
 		 221 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  47.98 
 
 		 224 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  41.89 
 
 		 234 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 208 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.18 
 
 		 217 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  46.46 
 
 		 222 aa  165  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.69 
 
 		 205 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 215 aa  163  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44 
 
 		 216 aa  162  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  45.18 
 
 		 215 aa  162  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.07 
 
 		 214 aa  162  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 215 aa  161  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 213 aa  161  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 211 aa  161  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 212 aa  161  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 207 aa  161  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 208 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 209 aa  160  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 205 aa  160  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  44 
 
 		 204 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.78 
 
 		 218 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 214 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 208 aa  159  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49.21 
 
 		 244 aa  159  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 211 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.07 
 
 		 222 aa  159  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  45.55 
 
 		 234 aa  159  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.56 
 
 		 205 aa  158  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.1 
 
 		 204 aa  158  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 205 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 217 aa  157  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 210 aa  157  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  44.44 
 
 		 207 aa  157  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 213 aa  157  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 209 aa  156  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 210 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  48.45 
 
 		 244 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 212 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 225 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 225 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 225 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 213 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 209 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 211 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  39.61 
 
 		 217 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.24 
 
 		 233 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  44.5 
 
 		 215 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 234 aa  155  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  42.05 
 
 		 199 aa  155  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 207 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  43.3 
 
 		 203 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 204 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 221 aa  154  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  46.39 
 
 		 240 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>