More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0927 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  56.85 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  52.31 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.02 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  50.77 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  47.74 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.36 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  44.9 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  45.54 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.58 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  47.57 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.2 
 
 		 226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  41.45 
 
 		 221 aa  160  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  40.61 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  40 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.54 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  38.69 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.88 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 686 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.05 
 
 		 901 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 220 aa  154  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.2 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.62 
 
 		 688 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.21 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.56 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  40.51 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  38.31 
 
 		 686 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  40.3 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 211 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 211 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  39.8 
 
 		 212 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  38.81 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.56 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  39.61 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  39.2 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.58 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  38.92 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  38.31 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  39.39 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.42 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  38.31 
 
 		 210 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  36.18 
 
 		 224 aa  148  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  45.51 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.07 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  38.92 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.17 
 
 		 688 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  38.92 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  37.8 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  42.53 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.2 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  44.09 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  38.69 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  42.58 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  39.22 
 
 		 703 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 707 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.25 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  39.7 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  37.25 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  40 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  41.33 
 
 		 662 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  40.56 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>