More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0740 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 725 aa  1421    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  49.69 
 
 		 727 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  38.26 
 
 		 730 aa  363  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  39 
 
 		 686 aa  360  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  38.62 
 
 		 709 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  35.7 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  36.15 
 
 		 688 aa  341  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  35.48 
 
 		 901 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  37.21 
 
 		 686 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 707 aa  270  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  34.21 
 
 		 662 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 710 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  34.82 
 
 		 705 aa  236  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  30.93 
 
 		 707 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  34.2 
 
 		 703 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  32.58 
 
 		 642 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  30.68 
 
 		 671 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.26 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.37 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  22.97 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  24.26 
 
 		 460 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.97 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  22.75 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.97 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  34.06 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 401 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 420 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  32.61 
 
 		 213 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  32.37 
 
 		 210 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.79 
 
 		 1833 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.36 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.36 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  29.08 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.36 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.36 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  36.36 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.36 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.36 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  23.58 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  34.06 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  32.58 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  24.6 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  23.74 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  23.39 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  32.12 
 
 		 206 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 486 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  29.75 
 
 		 221 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 219 aa  56.6  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 406 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.5 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  31.11 
 
 		 208 aa  55.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.5 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  34.33 
 
 		 210 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 213 aa  55.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  32.35 
 
 		 207 aa  55.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 441 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 423 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.71 
 
 		 217 aa  54.7  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 434 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.14 
 
 		 216 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 416 aa  54.7  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 397 aa  54.3  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.21 
 
 		 431 aa  54.3  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  31.97 
 
 		 415 aa  54.3  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  28.68 
 
 		 213 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  26.54 
 
 		 422 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.45 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  38.96 
 
 		 281 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.54 
 
 		 422 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.76 
 
 		 1806 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 409 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 426 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.92 
 
 		 393 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.57 
 
 		 422 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  32.9 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>