185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7077 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
436 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  47.75 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  44.15 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
434 aa  273  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 
441 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  45.69 
 
 
427 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  45.69 
 
 
427 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  45.69 
 
 
427 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  41.77 
 
 
441 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 
442 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 
427 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
434 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  40.43 
 
 
432 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 
416 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  37.8 
 
 
436 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  43.5 
 
 
450 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  41.63 
 
 
433 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  41.73 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  42.57 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  42.93 
 
 
476 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  40.96 
 
 
432 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
431 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
491 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
727 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  31.13 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  30.52 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  26.29 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  23.68 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  27.35 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.25 
 
 
730 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  18.97 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.42 
 
 
457 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  19.19 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  19.19 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  19.19 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  31.49 
 
 
413 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  18.97 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  19.19 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
463 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  28.27 
 
 
901 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  18.43 
 
 
410 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  34.94 
 
 
709 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  32.24 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  25.31 
 
 
460 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
1833 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  29.85 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
432 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  26.7 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  27.37 
 
 
705 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  37.07 
 
 
662 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  28.97 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.95 
 
 
686 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.39 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  32.12 
 
 
688 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.63 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  34.51 
 
 
688 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.65 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 
446 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.04 
 
 
471 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  32.32 
 
 
433 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  31.82 
 
 
598 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
407 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  22.2 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  23.89 
 
 
543 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  35.71 
 
 
454 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  32.32 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  32 
 
 
512 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  35.26 
 
 
686 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
725 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  33.76 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  27.37 
 
 
703 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  34.71 
 
 
707 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.11 
 
 
404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.11 
 
 
404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
421 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  28.46 
 
 
543 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.85 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.85 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  30.05 
 
 
426 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  32.22 
 
 
438 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.33 
 
 
404 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0055  hypothetical protein  24.19 
 
 
400 aa  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  25.4 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>