91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5482 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  100 
 
 		 427 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  100 
 
 		 427 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  100 
 
 		 427 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  73 
 
 		 427 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  71.36 
 
 		 454 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  67.62 
 
 		 441 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 434 aa  295  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  48.26 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  35.54 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  36.54 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  36.67 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  36.69 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  37.16 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 476 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  33.01 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.15 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.2 
 
 		 709 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  27.3 
 
 		 688 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  30.58 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.86 
 
 		 730 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6155  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 725 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  34.29 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  24.8 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 686 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  34.26 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 543 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  21.72 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  35.14 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  33.06 
 
 		 662 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  26 
 
 		 547 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.54 
 
 		 1833 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  28.68 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  26.61 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  29.17 
 
 		 901 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.38 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  26.93 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  30.95 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  32.14 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  37.61 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  32.14 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 458 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  36.28 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  25 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 598 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  23.12 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  23.12 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  31.75 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  32.04 
 
 		 1816 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  32.41 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  37.17 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 411 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 686 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>