117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5077 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 416 aa  769    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  46.4 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 		 427 aa  252  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 450 aa  242  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  42.12 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 476 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  37.77 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  41.29 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  43.65 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  43.6 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  38.15 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 441 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  42.67 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  42.67 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  42.67 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  37.05 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 491 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  26.82 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  28.8 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0055  hypothetical protein  25.38 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  31.61 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30.39 
 
 		 707 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.95 
 
 		 686 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  26.78 
 
 		 705 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.47 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  29.71 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.39 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.39 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.03 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  26.16 
 
 		 703 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  19.9 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  26.34 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  27.46 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.72 
 
 		 688 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  24.69 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.75 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  30 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.71 
 
 		 1829 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  29.86 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  35.64 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  19.66 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  27.11 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>