90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3360 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  866    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  61.52 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  53.78 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  51.75 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  37.06 
 
 		 432 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  38.68 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  33.95 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  36.51 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 434 aa  183  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  34.29 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 476 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  35.11 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  33.49 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  32.69 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  32.69 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  32.69 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.15 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  23.53 
 
 		 707 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  25.51 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  28.8 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  26.94 
 
 		 533 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  27.34 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  23.08 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 710 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  22.54 
 
 		 432 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  26.05 
 
 		 703 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  36.81 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  23 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  25.77 
 
 		 705 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  25.79 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  18.5 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  21.46 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  24.93 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 598 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.89 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  24.2 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  27.25 
 
 		 707 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  18.99 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  17.72 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  19.72 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3313  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.437677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  31.32 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  32.98 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.21 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  23.82 
 
 		 688 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  24 
 
 		 688 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.6 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.35 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.35 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  19.6 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>