24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1711 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  80.19 
 
 
566 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  80.19 
 
 
566 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  88.01 
 
 
561 aa  915    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  80.19 
 
 
566 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  100 
 
 
533 aa  1063    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  72.52 
 
 
548 aa  729    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  58.45 
 
 
560 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  53.82 
 
 
663 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  49.7 
 
 
578 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  51.47 
 
 
548 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
576 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
515 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  40.23 
 
 
481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  37.02 
 
 
533 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  38.52 
 
 
598 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  37.41 
 
 
449 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  37.5 
 
 
529 aa  200  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  38.03 
 
 
543 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  36.08 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  31.82 
 
 
505 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  37.16 
 
 
426 aa  87.4  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
441 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  24.88 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>