24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4729 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1063    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  62.32 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  52.73 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  47.08 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  48.08 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  52.38 
 
 		 533 aa  364  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 566 aa  359  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  50.34 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  48.46 
 
 		 560 aa  343  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  47.76 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 515 aa  246  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 598 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  36.56 
 
 		 533 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 529 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  37.37 
 
 		 505 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  34.13 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 426 aa  100  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  25.84 
 
 		 1646 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  30 
 
 		 1745 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  27.39 
 
 		 2914 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>