32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0107 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  100 
 
 		 481 aa  931    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  44.89 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 449 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  42.92 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 543 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  47.59 
 
 		 515 aa  266  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  41.25 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  41.21 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  39.91 
 
 		 561 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  43.19 
 
 		 548 aa  232  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 663 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  36.66 
 
 		 548 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  38 
 
 		 566 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  38 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  38 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  36.65 
 
 		 560 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 576 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  25.98 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  31.71 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>