139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 432 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  62.12 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  58.28 
 
 		 491 aa  342  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 428 aa  320  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  43.87 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  39.58 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  40 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  38.35 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  39.39 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  36.27 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  35.28 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  37.33 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  37.33 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  37.33 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  28.78 
 
 		 707 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  26.54 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  27.61 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  29.74 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  26.37 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  33.99 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.99 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  30.23 
 
 		 662 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  21.11 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 543 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 727 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.7 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.7 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  22.94 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.71 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.82 
 
 		 901 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  21.7 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  24.1 
 
 		 709 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.34 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.7 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  23.91 
 
 		 730 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  23.56 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  30.3 
 
 		 547 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.04 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.78 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.84 
 
 		 688 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.19 
 
 		 645 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  28.57 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  29.85 
 
 		 688 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.11 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.2 
 
 		 1833 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  22.19 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  31.58 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  21.23 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>