195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3570 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 441 aa  855    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  68.31 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  49.76 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 		 427 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  38.94 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  44 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  45.06 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  40 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  36.06 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 434 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  36.3 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 454 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  36.67 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  36.67 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  36.67 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30 
 
 		 707 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.2 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.49 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.44 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.18 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.94 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  21.71 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  20.39 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  23.86 
 
 		 547 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.65 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  32.19 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  21.71 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.87 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  21.71 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.21 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  21.41 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  20.21 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.81 
 
 		 730 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.19 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  38.46 
 
 		 662 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 462 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.66 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 725 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.55 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  28.7 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.66 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  26.47 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.6 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.24 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.04 
 
 		 686 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  20.48 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  27.86 
 
 		 533 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  27.51 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  25.77 
 
 		 707 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  26.63 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.6 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.6 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  23.46 
 
 		 688 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.6 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  28.96 
 
 		 686 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0685  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter (DUF475 domain protein)  23.18 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.499831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  19.21 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>