More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3741 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  82.39 
 
 		 423 aa  614  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6319  hypothetical protein  41.79 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  34.99 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.17 
 
 		 1816 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.9 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.16 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.16 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.14 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.35 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.36 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  27.58 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.96 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  20.39 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.48 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.79 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.79 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.79 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  24.79 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  23.89 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  25.65 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  29.38 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.25 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  25.65 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  21.43 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  29.38 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  27.7 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.07 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  28.04 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.32 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  21.15 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  21.15 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  21.15 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  21.15 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  21.15 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  21.64 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  29.56 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2672  putative permease  24.37 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.929224  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.86 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.51 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  27.98 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.55 
 
 		 1833 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  29.53 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  28.09 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  26.24 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  21.21 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  21.21 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  23.24 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>