221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2448 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  792    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.86 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.32 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  24.23 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.14 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.32 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.14 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.86 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.78 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  28.71 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.72 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.33 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.15 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  25.71 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  21.94 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  25.08 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.55 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  24.13 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  24.71 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  24.14 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 445 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.2 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.26 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  22.99 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.96 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.96 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  22.99 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.59 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  23.88 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  22.99 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  22.99 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  22.03 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.73 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 710 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  22.7 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  24 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.13 
 
 		 1833 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  21.14 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.02 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  25.57 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  22.14 
 
 		 642 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>