More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0074 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  833    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  25.34 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.97 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 451 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.45 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.45 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.45 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.45 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.45 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  25.97 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.02 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.42 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 408 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  25 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  25 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  29.21 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.07 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  25 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  25 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  25 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  25 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  25 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.17 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.92 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  29.58 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.86 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 444 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.97 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  20.73 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.92 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.24 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  22.07 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  22.78 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  22.7 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.78 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.8 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  21.79 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.22 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0248  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766226  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  21.79 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.22 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  22.69 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.94 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  22.31 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  18.08 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.67 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3278  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  19.94 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.54 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  19.94 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.54 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  19.94 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.29 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  24.8 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>