More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2854 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  882    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  56.16 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  44.56 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  44.58 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 448 aa  299  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 412 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  37.24 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 421 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  31.4 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  26.7 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  28.95 
 
 		 709 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.56 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.21 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.41 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.68 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.68 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.18 
 
 		 730 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  26.09 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  25.21 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.22 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.2 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  22.3 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  25.5 
 
 		 1816 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.82 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  25.95 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  25.45 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.56 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.56 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  27.03 
 
 		 642 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20 
 
 		 405 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  20.7 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  22.59 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  19.51 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  25.66 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.62 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  25.67 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  27.41 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.62 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.62 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.72 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  21.71 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.8 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  25 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.14 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  25.47 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  25.47 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.95 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.74 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.1 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.62 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.58 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>