26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4233 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  816    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  40 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  36.62 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.05 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 419 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.17 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  26.7 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  31.96 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.14 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  19.95 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  19.95 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.2 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.95 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.97 
 
 		 1128 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>