79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4247 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  89.05 
 
 		 425 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  779    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  50.74 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 419 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  40.6 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  36.87 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  39.75 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  32.21 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  32.34 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  29.39 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.48 
 
 		 1833 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  20.53 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.87 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.52 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.86 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.86 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.25 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.25 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  22.18 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  21.72 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  30.05 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  21.98 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  19.54 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.14 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  22.18 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.72 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  22.18 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.52 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  22.4 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  32.93 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 406 aa  46.6  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  21.82 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  25.5 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  30.16 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  25.95 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  19.23 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.18 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.18 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3245  macrolide-efflux protein  20.36 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456931  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  30.3 
 
 		 527 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25.08 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.08 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>