243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 402 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  41.91 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  40.57 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  37.24 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 448 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  31.7 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.54 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.3 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  30.79 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.54 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.54 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  23.62 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.05 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.54 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.87 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.31 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  29.44 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.9 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.58 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.56 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  19.78 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  20.35 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  26.46 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.47 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.26 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  26.46 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.85 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.85 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  25.85 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  26.21 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  26.21 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.71 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.4 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  26.43 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  26.69 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  27.17 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5044  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.33 
 
 		 1833 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.19 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2338  putative multidrug efflux MFS transporter  29.21 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.52 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.52 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0792  putative multidrug efflux MFS transporter  31.42 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0904033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  23.58 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>