More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1016 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  26.99 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.53 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25.9 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25.9 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  25.96 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.23 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  25.96 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  26.22 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.36 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.36 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  21.98 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  21.98 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  33.92 
 
 		 535 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.2 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  30.59 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.15 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 450 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 474 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  21.18 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.68 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.68 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  26.09 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0422  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  33.45 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  27.02 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0248  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766226  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.94 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  31.44 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  37.29 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.62 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  37.29 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.68 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.42 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  23.88 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  23.66 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  36.72 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.72 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.02 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  31.22 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>