135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4635 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  854    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 465 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  33.08 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 419 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  32.01 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  32.32 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 412 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  31.13 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  26.33 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  28.26 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  27.02 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.22 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.91 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  28.85 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.78 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.48 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  23.28 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.61 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.61 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.36 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.17 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.75 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.09 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.09 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.09 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4679  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.44 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 461 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  24.47 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  24.64 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  24.68 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.24 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  25.44 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  30 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  21.39 
 
 		 553 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  27.71 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  30 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  23.41 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  25.38 
 
 		 688 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  25.39 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.09 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  25 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.02 
 
 		 1833 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  26.55 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.35 
 
 		 730 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  23.48 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>