114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2605 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
407 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
419 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  37.93 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  35.46 
 
 
431 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  32.37 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 
438 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  35.59 
 
 
425 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  37.31 
 
 
421 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  35.68 
 
 
396 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
412 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  31.3 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  31.33 
 
 
430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
434 aa  126  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  30.84 
 
 
465 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
407 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  31.39 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
437 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  28.23 
 
 
442 aa  96.7  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  20.53 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
433 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.23 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.68 
 
 
709 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.06 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.06 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  25.07 
 
 
443 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  22.52 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.4 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.4 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.45 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  22.52 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1878  permease  22.93 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  24.94 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  24.94 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  24.92 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  19.4 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  22.52 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  26.42 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2172  hypothetical protein  21.31 
 
 
405 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2144  hypothetical protein  21.31 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.494973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  22.49 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  25.94 
 
 
412 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.2 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1926  hypothetical protein  22.9 
 
 
409 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2073  hypothetical protein  22.9 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2104  hypothetical protein  22.9 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  31.07 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  22.94 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  26.36 
 
 
499 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  29.82 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  25.14 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
438 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  24.3 
 
 
730 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  28.9 
 
 
526 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  20.83 
 
 
1876 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  25.77 
 
 
414 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  26.34 
 
 
418 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  28.47 
 
 
410 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
421 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.32 
 
 
426 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  26.01 
 
 
418 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
428 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  25.13 
 
 
443 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.41 
 
 
688 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  21.11 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.33 
 
 
1833 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.68 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.44 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.68 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  24.35 
 
 
1769 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  21.91 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.6 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  21.91 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  27.51 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  25.34 
 
 
1816 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.59 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.6 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  28.29 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  29.65 
 
 
542 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>