More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4306 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  74.47 
 
 		 709 aa  1002    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  100 
 
 		 730 aa  1427    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.63 
 
 		 688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.34 
 
 		 688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.07 
 
 		 901 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.28 
 
 		 686 aa  534  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.59 
 
 		 662 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 707 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43.23 
 
 		 705 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.19 
 
 		 703 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 		 727 aa  399  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  42.7 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 710 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 725 aa  363  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.17 
 
 		 671 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  36.74 
 
 		 642 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  47.75 
 
 		 281 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  49.02 
 
 		 234 aa  174  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  47.49 
 
 		 210 aa  173  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  48.86 
 
 		 225 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  46.05 
 
 		 206 aa  169  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.79 
 
 		 207 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 213 aa  164  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 224 aa  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  44.26 
 
 		 222 aa  162  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.87 
 
 		 207 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  44.75 
 
 		 215 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.4 
 
 		 205 aa  151  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  43.04 
 
 		 243 aa  151  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.58 
 
 		 202 aa  147  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.04 
 
 		 210 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.53 
 
 		 213 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  36.57 
 
 		 206 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40.36 
 
 		 215 aa  144  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  42.92 
 
 		 214 aa  143  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  52.11 
 
 		 219 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  38.89 
 
 		 215 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  42.01 
 
 		 205 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  42.01 
 
 		 205 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  39.27 
 
 		 212 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  41.1 
 
 		 206 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  41.1 
 
 		 206 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  41.1 
 
 		 206 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  41.94 
 
 		 200 aa  140  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  37.33 
 
 		 213 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  41.59 
 
 		 211 aa  140  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  40.64 
 
 		 206 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 205 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  40.64 
 
 		 206 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  40.64 
 
 		 206 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40.99 
 
 		 206 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.09 
 
 		 214 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.02 
 
 		 217 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 209 aa  137  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.23 
 
 		 219 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  42.93 
 
 		 226 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.37 
 
 		 206 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  38.25 
 
 		 221 aa  137  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  39.09 
 
 		 210 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  39.55 
 
 		 210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 204 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.96 
 
 		 232 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 203 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  35.94 
 
 		 211 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 226 aa  135  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  39.45 
 
 		 206 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.21 
 
 		 210 aa  134  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  39.72 
 
 		 212 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.36 
 
 		 207 aa  133  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 226 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.71 
 
 		 217 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  33.81 
 
 		 203 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  35.93 
 
 		 234 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 213 aa  131  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  34.72 
 
 		 204 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  40.19 
 
 		 222 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  38.32 
 
 		 224 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  36.82 
 
 		 225 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  38.71 
 
 		 206 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  37.9 
 
 		 210 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 236 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  38.14 
 
 		 223 aa  130  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.79 
 
 		 210 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  36.2 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  37.98 
 
 		 216 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  37.27 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  33.04 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  39.55 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  37.56 
 
 		 222 aa  128  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 213 aa  129  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>