More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1425 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  97.07 
 
 		 205 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  89.76 
 
 		 205 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  67.49 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  70.24 
 
 		 200 aa  284  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 206 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  65.52 
 
 		 206 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 206 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 206 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 206 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  67.49 
 
 		 206 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  66.5 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  65.69 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  66.01 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  66.01 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  68.93 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  60.4 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  57.07 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  58.33 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  59.07 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  53.17 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  51.46 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  49.06 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 217 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  58.71 
 
 		 233 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  46.85 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  50 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  49.27 
 
 		 210 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  53.14 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  54.3 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  47.57 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  49.29 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  50 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  48.56 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  46.53 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.67 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 901 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  44.9 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.98 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 688 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  44.88 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.62 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  39.42 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  45.99 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  45.08 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 705 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.54 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.29 
 
 		 703 aa  148  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  48.4 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.62 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  41.75 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  38.42 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  43.2 
 
 		 662 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  45.5 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  45.7 
 
 		 281 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.31 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  41.18 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.25 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.56 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  43.16 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  41.24 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  45.92 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>