More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1588 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1588  dTMP kinase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0735324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1913  thymidylate kinase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.325881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.78 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  49.21 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  46.63 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.54 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.99 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.22 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.93 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.7 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  44.72 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  48.96 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  47.26 
 
 		 688 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  46.56 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  46.56 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  41.71 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.83 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  43 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  43 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  41.03 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  43.59 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  46.2 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  40.45 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  43.59 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 203 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  41.1 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  45.15 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  43.23 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  38.54 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  44 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42 
 
 		 901 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  40.61 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.59 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.57 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  44.12 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  41.12 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  38.05 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  44 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  38.05 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1918  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 209 aa  132  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>