More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1918 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1918  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  55.77 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  56.06 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  53.85 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  52.48 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  53.54 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  53.33 
 
 		 210 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  54 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  51.98 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  52.48 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  53.14 
 
 		 213 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  49.52 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  52.02 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  52.28 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  49.03 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  49.24 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.05 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  50.54 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  51.52 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  51.52 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  49.29 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.41 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  43.87 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  48.51 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.55 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.15 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  46.97 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  47.6 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.18 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.94 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  50.79 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  50.28 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  47.29 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.16 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  47.74 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  48.13 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  45.28 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  50.48 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 901 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  52.6 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  50.56 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.7 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>