More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1495 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  96.67 
 
 		 210 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  94.2 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  85.24 
 
 		 210 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  81.43 
 
 		 210 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  80.95 
 
 		 210 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  80.48 
 
 		 210 aa  328  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  79.52 
 
 		 210 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  76.67 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  77.45 
 
 		 211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  59.31 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  62.25 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  57.65 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  62.69 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  58.45 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  55.22 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  54.46 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  58.21 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 203 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  53.2 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  52.79 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  52.71 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  53.69 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  48.1 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  51.79 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  51.79 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  53.62 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  58.33 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  52.82 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  54.41 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  50.24 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  49.75 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  51.22 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  50.47 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  49.51 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.37 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  48.77 
 
 		 213 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  49.27 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  53.43 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.01 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  48.5 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  47.29 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 686 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 688 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  53.33 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  49.47 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 212 aa  178  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  50.74 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 705 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 213 aa  177  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  51.02 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  48.48 
 
 		 703 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  55.26 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 219 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  49.74 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  51.01 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  47.5 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  52.91 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.96 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  50.76 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  52 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  47.44 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49.75 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  45.23 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>