More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0156 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  48.48 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  48.98 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  47.26 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 671 aa  187  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.23 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.88 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.54 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 901 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 686 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.83 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 707 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.58 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  42.06 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  43.96 
 
 		 229 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.07 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 214 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.63 
 
 		 688 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  49.46 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  44.61 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  43.14 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 209 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.12 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  39.42 
 
 		 225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.29 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41.38 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.32 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 686 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 213 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.28 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.42 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  40.5 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  44.04 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 688 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  41.87 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  45.45 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 211 aa  167  9e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.36 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.85 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  41.33 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.33 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.43 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  40 
 
 		 703 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.29 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  40.62 
 
 		 226 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  40.59 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  41.75 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  38.92 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40 
 
 		 705 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  42.29 
 
 		 662 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  42.44 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  43 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  37.91 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  43.56 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  44.78 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>