More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0372 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  51.92 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 213 aa  214  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  53.3 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 208 aa  201  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  48.48 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  47.6 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  51.81 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  48.99 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.14 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 203 aa  184  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  51.37 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.68 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.63 
 
 		 686 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 686 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 707 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 705 aa  174  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.19 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.87 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 671 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.73 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.96 
 
 		 703 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 688 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.1 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.02 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.9 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  41.98 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.71 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 209 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  41.63 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.06 
 
 		 688 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  51.98 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.98 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  46.56 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.42 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  43.65 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.64 
 
 		 901 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.13 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.37 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  40.53 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.14 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.47 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  40.87 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.62 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  38.68 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  39.53 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.97 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>