More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1128 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  53.3 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  44.71 
 
 
210 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  43.69 
 
 
209 aa  177  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.88 
 
 
203 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  44.23 
 
 
214 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.93 
 
 
206 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  43.41 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.72 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  43.27 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43 
 
 
216 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.48 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  43.96 
 
 
208 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.67 
 
 
207 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  167  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  42.36 
 
 
208 aa  167  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  42.08 
 
 
211 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  42.93 
 
 
205 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  43.54 
 
 
213 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  42.93 
 
 
205 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.44 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  35.1 
 
 
217 aa  161  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.7 
 
 
216 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.03 
 
 
686 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  41.87 
 
 
203 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42.35 
 
 
197 aa  158  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  42.71 
 
 
210 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  41.15 
 
 
213 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  37.86 
 
 
210 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  36.89 
 
 
209 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.5 
 
 
207 aa  155  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.1 
 
 
901 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  43.93 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.23 
 
 
233 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  37.5 
 
 
219 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  36.41 
 
 
232 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.54 
 
 
218 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  36.57 
 
 
225 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  39.52 
 
 
212 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  39.9 
 
 
212 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  36.89 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  37.31 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  39.52 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  37.38 
 
 
210 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  37.25 
 
 
225 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  37.32 
 
 
234 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.23 
 
 
210 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.2 
 
 
219 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  37.44 
 
 
213 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  34.51 
 
 
234 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.2 
 
 
217 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  35.55 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  36.54 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  35.18 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  35.18 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  35.92 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.62 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  37.02 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  40.82 
 
 
203 aa  145  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  36.32 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  39.42 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  37.56 
 
 
222 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  40.61 
 
 
212 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.14 
 
 
222 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.28 
 
 
217 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.29 
 
 
206 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  38.27 
 
 
208 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  36.06 
 
 
215 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.24 
 
 
221 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  35.92 
 
 
225 aa  141  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  35.61 
 
 
671 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  37.56 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  36.95 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.76 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  33.65 
 
 
216 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  36.71 
 
 
236 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38 
 
 
707 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  43.15 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  36.84 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  37.07 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  35.71 
 
 
218 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  37.31 
 
 
214 aa  138  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  38.34 
 
 
244 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.07 
 
 
703 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  33.33 
 
 
226 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.07 
 
 
705 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  34.67 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  37.38 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  37.91 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  40.21 
 
 
207 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  37.56 
 
 
208 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>