More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1461 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  46.6 
 
 
219 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.27 
 
 
203 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.72 
 
 
207 aa  167  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.23 
 
 
219 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.95 
 
 
205 aa  161  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.08 
 
 
207 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  43.07 
 
 
217 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.44 
 
 
207 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42 
 
 
206 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.78 
 
 
223 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.56 
 
 
217 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.59 
 
 
208 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.09 
 
 
216 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.98 
 
 
213 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.16 
 
 
202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  43 
 
 
214 aa  151  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.23 
 
 
212 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.57 
 
 
207 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.51 
 
 
204 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.23 
 
 
225 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  43.43 
 
 
197 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.4 
 
 
901 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40 
 
 
214 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  42.93 
 
 
207 aa  148  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  39.23 
 
 
211 aa  147  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  41.67 
 
 
209 aa  147  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.59 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  43.41 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  41.29 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  40.82 
 
 
209 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  39.2 
 
 
210 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  41.55 
 
 
219 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.21 
 
 
671 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  41.09 
 
 
212 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.38 
 
 
225 aa  144  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.1 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  42.05 
 
 
234 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  40.88 
 
 
295 aa  143  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.56 
 
 
688 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40.59 
 
 
213 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  41.54 
 
 
208 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.13 
 
 
686 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  42.05 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.87 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  41.5 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  39.5 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  40.67 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  41.67 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  36.6 
 
 
236 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  37.98 
 
 
226 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  39.7 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  40.69 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  39.42 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  36.36 
 
 
234 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.21 
 
 
686 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  41.38 
 
 
216 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  38.31 
 
 
210 aa  138  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.78 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  38.54 
 
 
212 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  41.67 
 
 
226 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  40.41 
 
 
210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  38.54 
 
 
244 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.3 
 
 
215 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  38.69 
 
 
212 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.81 
 
 
213 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.63 
 
 
210 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  40.1 
 
 
222 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  37.8 
 
 
229 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  41.24 
 
 
707 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  39.32 
 
 
214 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  38.65 
 
 
219 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40 
 
 
199 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.69 
 
 
212 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  39.39 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  38.5 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  38.05 
 
 
203 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  41.36 
 
 
210 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  40.93 
 
 
225 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  37.56 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  38.16 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  38.16 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  40.69 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.93 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  36.41 
 
 
211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  40.93 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.04 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  41.12 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  39.38 
 
 
210 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  38.83 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  38.69 
 
 
212 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  37.76 
 
 
208 aa  131  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1962  thymidylate kinase  38.5 
 
 
203 aa  131  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.113486  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  41.45 
 
 
213 aa  131  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.16 
 
 
225 aa  131  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.51 
 
 
217 aa  131  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  39.81 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  39.38 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  43.01 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  40.51 
 
 
688 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>